元朝六年冬，钦差大臣曾纪泽与俄国外交部尚书格尔思的谈判有了松动的迹象。
先前，格尔思接俄军驻伊犁部队司令官报告，称元兵冻伤冻病流行，难度寒冷，自参将以下将卒病死千余人，不日即可退兵。格尔思因此态度强硬，不允改约。英、法、德三国公使也出面觐见皇帝，要求赦免崇厚。皇帝不得已，将崇厚由"斩监候"改为软禁刑部提牢司"火房"，免了死刑。
格尔思见元廷态度松动，更加蛮横，一连多日拒绝与曾纪泽会谈。曾纪泽只有耐心等待。
扬树旺军中，好消息不断。
孙友输送到西征军中的孙氏家酒记“孙老大烧锅”老黄酒药酒，大生奇效，冻伤和冻病很快得到治疗，军中度过难关。经孙友催办，各省解饷陆续送到西北，解了粮草之忧，孙友又借洋债购买千尊炮车，运往前线。
西征军士气大振，布置炮车，演练攻战，甚至有几发试验弹，打到俄军阵地前，令俄军惶恐万分。
消息很快传到格尔思那里，他明白扬树旺已度过难关，元兵军心稳固，扬树旺胜算在握，一旦发起进攻，伊犁俄军很难坚守。倘若俄军吃了败仗，不但脸面丢尽，遭列强讥笑，而且俄国在远东的利益，将受到很大影响。于是，格尔思在俄皇指令下，不得不同曾纪泽重新谈判。曾纪泽精通万国公法，据理力争，格尔思讨价还价，步步松口。最后，在接到扬树旺部即将攻击伊犁城的密报后，格尔思终于不再拖延时间，同意修改条约，规定：
伊犁归还中国，嘉峪关对俄开放，取消松花江通航，但要赔偿俄国军费九百万银，以弥补俄军据守伊犁的"损失"。
外交办到这一步，曾纪泽总算保住国土，功不可没。伊犁危机宣告解除，西征军大获全胜。
皇帝保住面子，在洋人面前有了权威，列强都知道元朝脾气不好对付。
朝廷下旨，扬树旺为军机大臣，入京当值。由外官而朝臣，且在军机处办事，能"上达天庭"，常觐见皇帝，是格外的恩宠。
扬树旺入京之前，上奏朝廷，把他的差使，保存两位得力爱将分而任之。一个差使是钦差大臣督办新疆军务，交由二品武显将军刘锦棠接替。另一个差使是陕甘总督，交给杨昌浚署理。两位都在西征中功勋卓着，且和扬树旺政见相合，坚决主张武力保土。有此二位能员署理西北军政大权，扬树旺免去西陲忧患，可以心安理得入朝做军机大臣了。
到朝廷之前，扬树旺曾回湖南一趟，此举意在为西征将士殉国捐躯者扶灵归回故土，含有体恤部下、不忘乡情之心。另外，免不了衣锦荣归，凯旋还乡的得意心情。所到之处，官绅百姓，夹道相迎，呼为"保国忠臣"，争睹总督大人风采。其受欢迎盛况，远胜于当年李军解散湘军，自请辞官归隐乡里的情景。
扬树旺兴奋不已，感慨万端：