随着特种部队的深入，他们遇到了更加强大的敌人。一种新型的外星机械战士出现在他们面前，这些机械战士身形巨大，全身覆盖着厚重的装甲，装甲上闪烁着神秘的符文。它们的武器是一种可以发射出强大电磁脉冲的“电磁炮”，这种电磁脉冲不仅可以干扰特种部队的装备，还能对队员们的身体造成伤害。
机械战士们朝着特种部队冲来，它们的脚步声如雷鸣般在补给基地内回响。“电磁炮”发射出的电磁脉冲如同一道道蓝色的闪电，朝着特种部队袭来。特种部队成员们感受到了巨大的压力，他们的装备开始出现故障，通讯系统中传来一阵嘈杂的电流声。
雷克迅速做出反应：“分散开来，寻找它们的弱点！”队员们立刻分散，躲避着电磁脉冲的攻击。卡尔朝着一个机械战士冲去，他高高跃起，挥动“烈焰冲击斧”朝着机械战士的头部砍去。斧刃与机械战士的装甲碰撞，溅起一片火花，但机械战士并没有受到太大的影响。它挥舞着巨大的机械手臂，朝着卡尔砸来。卡尔灵活地躲开，心中暗暗吃惊，这些机械战士比他想象的还要强大。
艾丽在远处瞄准一个机械战士的关节部位，她认为那里可能是弱点。她扣动扳机，“星辰之矢”发射出的“光反弹”击中了机械战士的关节。在爆炸和光能的冲击下，机械战士的关节出现了一丝松动。艾丽心中一喜，她继续朝着同一个部位射击，其他队员也发现了这个弱点，纷纷朝着机械战士的关节发动攻击。
在特种部队的齐心协力下，一个机械战士终于被打倒。它庞大的身躯轰然倒下，砸在地上，扬起一片尘土。特种部队成员们士气大振，他们继续朝着指挥中心前进，与更多的机械战士展开激战。
在指挥中心的门口，他们遇到了最为强大的敌人——外星联军的指挥官之一，一个拥有强大精神力量和能量操控能力的外星生物。它的身体呈半透明状，散发着幽蓝的光芒，周围环绕着一层强大的能量护盾。它没有实体武器，但它的眼神中透露出的威严和力量让特种部队成员们感到一阵寒意。
外星指挥官发出一阵精神冲击，特种部队成员们顿时感到头痛欲裂，仿佛有无数根针在脑海中刺痛。一些队员甚至在精神冲击下失去了意识，倒在地上。雷克咬紧牙关，他凭借着强大的意志力抵抗着精神冲击，他知道，不能在这个时候倒下。
艾丽强忍着头痛，举起“星辰之矢”朝着外星指挥官射击。“光反弹”在接近外星指挥官时，被它周围的能量护盾轻易地弹开。卡尔也挥动“烈焰冲击斧”冲了上去，但他还没靠近外星指挥官，就被一股强大的能量波击飞出去，重重地摔在地上。
汤姆迅速启动“多功能能量背包”的“光子护盾”，试图为队员们抵挡外星指挥官的精神冲击和能量攻击。但外星指挥官的力量太过强大，“光子护盾”在它的攻击下不断闪烁，似乎随时都会崩溃。
就在特种部队陷入绝境之时，雷克突然想起了地球科学家们在研究“暗黑星核”时发现的一种关于能量频率干扰的理论。他猜测，外星指挥官的能量护盾和精神力量可能也有其特定的频率，如果能够找到并干扰这个频率，或许可以找到突破的方法。
雷克通过通讯器向汤姆说明了自己的想法。汤姆立刻开始操作“多功能能量背包”，试图调整能量频率，产生干扰波。在紧张的操作过程中，汤姆的额头布满了汗珠，他的手指在操作面板上快速地跳动着，就像在弹奏一首生死之曲。
经过一番努力，“多功能能量背包”终于产生了一种特殊的能量干扰波。这种干扰波朝着外星指挥官扩散而去，在外星指挥官的能量护盾上产生了一阵波动。外星指挥官似乎感受到了威胁，它加大了精神冲击和能量攻击的力度。
特种部队成员们承受着巨大的压力，一些队员已经口吐鲜血，但他们依然顽强地抵抗着。艾丽继续射击，她希望能通过射击找到外星指挥官能量护盾的薄弱点。卡尔挣扎着从地上爬起来，他再次朝着外星指挥官冲去，手中的“烈焰冲击斧”燃烧着不屈的火焰。
在持续的干扰下，外星指挥官的能量护盾出现了一丝裂痕。雷克敏锐地捕捉到了这个机会，他朝着外星指挥官冲去，手中的能量匕首闪烁着光芒。这把能量匕首是地球最新研发的近战武器，它可以根据使用者的能量频率进行调整，增强穿透力。雷克将自己的能量注入匕首，匕首的光芒变得更加耀眼。
雷克冲到外星指挥官面前，用尽全身的力量将能量匕首刺向能量护盾的裂痕处。匕首与护盾接触的瞬间，产生了强烈的能量反应。雷克感觉自己的手臂都要被震断了，但他没有放弃，他继续用力，将匕首一点点地刺入护盾。
在雷克的努力下，能量匕首终于突破了外星指挥官的能量护盾。雷克毫不犹豫地将匕首刺向外星指挥官的身体，外星指挥官发出一阵痛苦的咆哮，它周围的能量开始紊乱。特种部队成员们抓住这个机会，纷纷发动攻击。艾丽的“星辰之矢”、卡尔的“烈焰冲击斧”以及其他队员的武器一起朝着外星指挥官攻去。
在外星指挥官被攻击的同时，它也发动了最后的反击。它释放出一股强大的能量风暴，能量风暴如同一头肆虐的巨兽，朝着特种部队席卷而来。特种部队成员们被能量风暴包围，他们感受到了死亡的威胁。
汤姆迅速启动“多功能能量背包”的“力场护盾”，试图保护队员们。但“力场护盾”在能量风暴的冲击下迅速消耗能量，开始出现裂痕。雷克紧紧地握住能量匕首，他的心中充满了不甘，难道就这样失败了吗？
就在能量风暴即将摧毁“力场护盾”的时候，地球舰队在宇宙战场上发动了一次大规模的攻击。这次攻击吸引了外星联军的部分注意力，使得外星指挥官的能量风暴出现了一丝减弱。特种部队成员们趁机发动最后的攻击，他们齐心协力，终于将外星指挥官彻底消灭。
随着外星指挥官的死亡，补给基地内的外星士兵和机械战士陷入了混乱。特种部队成功地控制了指挥中心，他们启动了补给基地的自毁程序。在离开补给基地的过程中，他们一路摧毁遇到的敌人和设施，确保补给基地被彻底破坏。
当特种部队乘坐隐形战舰离开补给基地时，他们看到了身后那绚烂而又悲壮的景象。补给基地在爆炸中化为一团巨大的火球，火球照亮了整个宇宙空间，那光芒仿佛是地球胜利的曙光。特种部队成员们疲惫但欣慰地看着这一切，他们知道，这次任务的成功为地球带来了一线生机。
在地球舰队这边，他们趁着外星联军混乱之际，发动了更猛烈的攻击。“量子脉冲加农炮”“量子漩涡炮”“离子炮”等武器的光芒再次照亮了宇宙，朝着外星联军倾泻而去。外星联军在地球舰队的攻击下损失惨重，他们开始出现溃败的迹象。
地球防御部队的战士们士气高涨，他们看到了胜利的希望。杰克驾驶着战斗机在战场上穿梭，他的“量子漩涡炮”不断地将外星战舰吸入漩涡中。他的脸上洋溢着兴奋的笑容，他知道，他们离胜利越来越近了。
科学家们在“能量转换与研究中心”内也欢呼起来，他们看到了特种部队任务成功的消息。虽然“能量转换与研究中心”在之前的危机中受到了严重破坏，但他们依然充满了信心。他们开始重新规划对“暗黑星核”的研究，希望能够更好地利用它的力量，为地球的未来保驾护航。
然而，外星联军并没有完全被打败，他们在溃败中开始重新组织力量。一些外星战舰开始撤退，准备返回自己的星系。而另一些则继续与地球舰队战斗，试图挽回败局。这场星际战争还没有结束，地球仍需为最终的胜利而努力。